藥械部于2014年重新組建并更名，于2003年成立臨床藥學室并開展血藥濃度監(jiān)測，是云南省第三家開展此項目的醫(yī)院，藥械部是集藥品采購供應(yīng)、藥品調(diào)劑、臨床合理用藥指導、教學、科研為一體的綜合科室。現(xiàn)由調(diào)劑科、采購供應(yīng)科、臨床藥學科、制劑室四個部門組成。調(diào)劑科包含本部門診藥房、本部中心藥房、本院靜脈藥物配置中心（PIVAS）、審方中心、北城中心藥房、北城PIVAS、東城藥房、口腔醫(yī)院藥房共8個部門。藥械部的發(fā)展已經(jīng)由被動藥品供應(yīng)保障工作向主動提高優(yōu)質(zhì)藥學服務(wù)方向轉(zhuǎn)變，積極支持醫(yī)院臨床科室的藥品保障供應(yīng)、合理用藥，擴大了科室的專業(yè)度和知名度，提升了自身素質(zhì)。
目前共有126人，其中研究生學歷16人，本科學歷89人。正高專業(yè)技術(shù)人員2人，副高專業(yè)技術(shù)人員20人，中職專業(yè)技術(shù)人員38人，初級專業(yè)技術(shù)人員49人。
藥房共有5臺智能化設(shè)備，其中包括4臺智能化包藥機、1臺整盒發(fā)藥機，承擔了全院藥品的儲存、養(yǎng)護、配送等工作。
2006年成立曲靖市首家靜脈藥物配置中心，2015年成功申報國家級臨床藥師規(guī)培基地，2017年成為曲靖市藥事管理與臨床藥學質(zhì)控中心掛靠科室，2018年11月籌建審方中心，2019年4月在云南省率先上線處方前置審核系統(tǒng)，2020年成立GCP藥房。
制劑室專業(yè)從事醫(yī)療機構(gòu)制劑的研究、開發(fā)與配制。制劑室現(xiàn)有制劑品種76個，可配制28種劑型。是市政府批準設(shè)立的曲靖市天然藥物研發(fā)中心，是云南省民族民間醫(yī)藥學會民族藥制劑專委會的主委單位。現(xiàn)有院外調(diào)劑使用單位11家，調(diào)劑至院外品種共22個。
科室先后申報省級科研項目1項，市級、院部級及昆明醫(yī)科大學科研項目5項，曲靖市科技進步獎二等獎，發(fā)表北大核心期刊1篇，科技核心期刊10余篇，中文期刊數(shù)篇?？剖以@國家級品管圈優(yōu)秀獎、省級三等獎，并在其他全國性藥學比賽中多次問鼎，在云南省藥師技能大賽中榮獲一、二等獎，在院內(nèi)舞蹈、合唱、演講等比賽中均摘得桂冠。
